環(huán)抗生素型手性色譜柱是一種新型的手性色譜柱，通過將大環(huán)抗生素鍵合到硅膠上而發(fā)展起來。這種色譜柱常用的大環(huán)抗生素有三種:利福霉素（Rifamycin），萬古霉素（Vancomycin），替考拉寧（Ticoplanin）。利福霉素作為一種手工添加劑，已成功應(yīng)用于毛細(xì)管電泳分離手工化合物。萬古霉素和替考拉寧的分子結(jié)構(gòu)“杯”狀結(jié)構(gòu)區(qū)和糖“平面”結(jié)構(gòu)區(qū)域。這種色譜柱性質(zhì)穩(wěn)定，可用于多種分離模式?；跉滏I的手分離，π-π形成包合物、離子和肽鍵。

替考拉寧分子量為1885，結(jié)構(gòu)中有20個手性中心、3個糖基和4個環(huán)。多肽酸性基團“杯”/“裂層”在它的一端，堿性基團在它的另一端。酸性基團和堿性基團提供離子作用點。糖基在三個平面上化合物分子埋在肽中“杯”中。

萬古霉素分子量為1449，結(jié)構(gòu)中有18個手中心和3個環(huán)。萬古霉素“籃狀”結(jié)構(gòu)，附近有一個彎曲的糖平面，可以將分析物分子埋在里面“籃子”中間。羧基和仲氨基分布在“籃子”參與和分析物分子的邊緣產(chǎn)生離子效應(yīng)。萬古霉素手色譜柱可用于反相模式、正相模式和極性模式。萬古霉素手色譜柱可分離胺、中性酰胺和脂類。但酸性化合物的選擇性較低。在反相模式下，四氫呋喃、乙腈和甲醇常用于有機相。三乙胺-乙酸緩沖液常用于水相。適用于色譜柱pH范圍為4-7。堿性化合物手性分離條件通常在優(yōu)化時進(jìn)行選擇pH=7起點更好。此外，四氫呋喃和乙腈具有最佳選擇性。有時純甲醇和乙醇也能達(dá)到良好的分離效果。萬古霉素手性色譜柱也可采用正相模式，正己烷/乙醇為流動相。